El Departamento de Medio Ambiente, Planificación Territorial, Agricultura y Pesca coordina las acciones relacionadas con los siguientes laboratorios agrarios dependientes de distintas instituciones:

- Centro Eskalmendi, laboratorio agrario y pecuario (DFA). Análisis de piensos y campañas de saneamiento ganadero.

Vicente Goikoetxea 6. Vitoria-Gasteiz
Teléfonos: 945181837 / 945181834

- Granja Foral de Derio, laboratorio general agricultura y sanidad vegetal (DFB). Campañas de saneamiento ganadero, txakolí y sidras y patología vegetal.

Av/Madariaga 1. Bilbao, Bizkaia
Teléfonos: 944066993 / 944066866 / 944066887 / 944066972

- Instituto Lactológico de Lekunberri. Control lechero, pago por calidad de la leche y productos lácteos.

Plazaola 23. Lekunberri, Navarra
Teléfonos: 948604555 /948604535

- Laboratorio Agroambiental de Fraisoro (DFG). Sustratos, enmiendas orgánicas y compost, aguas y vertidos, calidad agroalimentaria, nutrición animal, análisis foliares y campañas de saneamiento ganadero.

Apartado 240 Zizurkil Gipuzkoa
Teléfonos: 943691064 /943693304

- Laboratorio de Análisis Alimentarios (AZTI Tecnalia). Análisis químicos, microbiológicos y sensoriales de alimentos.

Isla de Txatxarramendi. Sukarrieta, Bizkaia
Teléfonos: 946029400 /946870006

- Neiker. Diagnóstico en patología animal, parasitología, virología, histopatología, microbiología, nematología, necropsias, EEBB Virología, hongos fitopatógenos, control de semillas, alimentos de consumo animal, análisis foliares, químicos y toxicológicos, aguas y fertilizantes y técnicas en biología molecular para detección de OMGs.

Berreaga 1. Derio, Bizkaia
Teléfonos: 944034300 /944034310

- Servicio de Viticultura y Enología (DFA). Análisis enológicos

Casa del Vino Laguardia, Álava
Teléfonos: 945621080 / 945621070